特别行动预备队在成功击退神秘敌人并保护好遗迹中的科技力量后，开始对这次的事件进行深入的调查和分析。他们深知，这次的遭遇只是冰山一角，背后隐藏着一个巨大的阴谋。
回到基地，队员们立刻投入到紧张的工作中。汤姆和艾米对从遗迹中获取的数据进行解码和研究，试图找出神秘敌人的来源和目的。卡尔和杰克则负责整理战斗中的情报，分析敌人的战术和武器装备。
莉亚则与星系联盟的高层进行沟通，争取更多的资源和支持。
“我们必须尽快弄清楚这些敌人的身份和他们背后的势力，否则宇宙将面临更大的危机。”莉亚在会议上严肃地说道。
经过几天几夜的努力，汤姆和艾米终于有了重大发现。
“这些数据显示，神秘敌人似乎与一个被称为‘黑暗军团’的组织有关。这个组织已经在暗中活动了很长时间，他们企图掌控整个宇宙的力量。”汤姆说道。
艾米接着补充道：“而且，从遗迹中的线索来看，他们正在寻找一种能够毁灭一切的终极武器。”
这个消息让特别行动预备队的队员们感到震惊和愤怒。
“我们绝对不能让他们得逞！”卡尔握紧了拳头。
杰克点了点头，“但我们目前对这个‘黑暗军团’的了解还太少，需要进一步的调查。”
就在这时，星系联盟传来警报，多个星系出现了异常的能量波动，疑似与“黑暗军团”的活动有关。
特别行动预备队立刻出发，前往这些星系进行调查。他们发现，这些星系的星球上出现了一些奇怪的符号和建筑，似乎是“黑暗军团”的标记。
“这是他们的前哨站，看来他们正在加快行动的步伐。”莉亚说道。
在调查过程中，特别行动预备队还遇到了一些当地居民的抵抗。原来，“黑暗军团”对这些居民进行了洗脑，让他们误以为特别行动预备队是敌人。
“我们必须想办法让他们清醒过来，共同对抗‘黑暗军团’。”艾米说道。
特别行动预备队开始与当地居民进行沟通和交流，向他们揭示“黑暗军团”的真实面目。经过一番努力，终于有一部分居民开始相信他们，并提供了一些重要的情报。
根据这些情报，特别行动预备队发现，“黑暗军团”正在筹备一场大规模的攻击，目标是星系联盟的核心区域。
“这将是一场前所未有的危机，我们必须做好充分的准备。”莉亚说道。
特别行动预备队开始制定防御计划，同时与星系联盟的其他力量进行联合。他们在各个战略要点部署了兵力和武器装备，准备迎接“黑暗军团”的攻击。
然而，在这紧张的时刻，特别行动预备队内部也出现了一些问题。一些队员因为长时间的战斗和压力，开始出现疲惫和焦虑的情绪。
“大家一定要坚持住，我们是宇宙的最后一道防线。”卡尔鼓励着队友们。
在这黑暗的预兆下，特别行动预备队能否团结一心，成功抵御“黑暗军团”的攻击，守护宇宙的和平与安宁呢？