其实特洛伊号此次航行时飞船上只有tS-1这几个人而已，主要是秦汉唐、宋民妍和伊西斯、恰娅·莎都能很轻松的驾驭这艘幽灵母舰，并不需要其他人上来冒险。
恰娅·莎虽然绝大部分时间都只是充当一个Npc似的观察者，但是开开飞船这种事她倒是从来没拒绝过。
此时特洛伊号上有着数百只各类动物，俨然是一个小型动物园，芮斯妍则负责通过遍布全舰的监控系统来监视它们的生命状况，这活对她来说简直不要太轻松。
从亚城星到阿瑟维斯星域的距离有近光年，以泰瑞纳斯号现在的航速只要不到一天就能到达，但是特洛伊号却需要近10天的时间。
不过这也正好符合宋民妍和伊西斯的试验需求，时间太短很可能自噬病毒还来不及变异。
秦汉唐在特洛伊号上待的这几天可算是让他深刻体验了一把星际航行的无聊，远没有他在亚特兰蒂斯有意思。
每天不是盯着小动物们的生命状态，就是看着多维空间里五彩斑斓的虚空通道发呆，现在他无比庆幸之前自己要和泰瑞纳斯号、欧若拉号一起出行的想法被老妈给摁了下来。
宋民妍和伊西斯一路上除了实时监控特洛伊号体内的自噬病毒状况之外，还在不断注入新的自噬病毒，直至将病毒浓度提升至临界状态。
当航程来到第七天的时候，她们终于发现一部分自噬病毒开始苏醒，然后它们就开始尝试接管特洛伊体内的神经网络。
不过由于一开始苏醒的自噬病毒数量并不多，它们并不能完全控制母舰，并且母舰感知到体内的自噬病毒的异样之后马上就做出了反应。
特洛伊号再次放出了免疫细胞，但是和上一次轻松压制自噬病毒的情况不同，这次自噬病毒展开了猛烈的反击，开始吞噬起免疫细胞来。
随着双方的火拼，自噬病毒被大规模唤醒，这个时候自噬病毒的霸道之处才真正展现出来。
自噬病毒全部苏醒之后，特洛伊号体内的免疫细胞开始渐渐落入下风。
随着越来越多的免疫细胞被吞噬，那些自噬病毒也似乎开始发生了变异。
一直在监控特洛伊号状态的宋民妍和伊西斯见到这种情况毫不犹豫的关闭了超光速引擎，让飞船从多维空间航行模式中退了出来。
她们在进行研究时一向小心谨慎，尤其是知道当年母巢战舰的遭遇，更是不会冲动冒险，趁着现在还可以控制战舰赶紧回归正常空间，万一战舰失控，在多维空间里可指望不上泰瑞纳斯号。
而且这个时候退出多维空间也是试验的一部分，宋民妍和伊西斯想看看当环境变化时自噬病毒是不是会偃旗息鼓，变回之前那副乖宝宝的模样。
一直紧跟着欧若拉号的泰瑞纳斯号此时自然也亦步亦趋的退出了多维空间，秦汉唐和朱思明取得联系之后，泰瑞纳斯号就将和欧若拉号的距离拉近到了可以使用光传送的范围内，一旦秦汉唐他们发出信号就能在第一时间将他们传送回泰瑞纳斯号。
自噬病毒并没有因为欧若拉号离开多维空间而变回乖宝宝，依然和免疫细胞进行惨烈的互殴，宋民妍和伊西斯这个时候也没闲着，提取了大量幽灵母舰的免疫细胞，这可是她们进行后续病毒合成试验的重要材料样本。
这场激烈的战斗在持续了一天之后最终以自噬病毒的全面胜利而结束，而此时的自噬病毒也已经不复原来的模样，彻底改头换面了，它的新形象和古人族科学家们当年提取的母巢病毒如出一辙。
至此宋民妍和伊西斯总算是知道了当年母巢战舰上发生了什么，自噬病毒和幽灵战舰自身的免疫细胞在相互吞噬的过程中发生了变异，变身成了母巢病毒，这才导致了后面发生的一切。
现在特洛伊号体内含有大量的母巢病毒，宋民妍和伊西斯自然也不会放过，进行了大量的采样。
自噬病毒变异成了母巢病毒之后，开始强行接管特洛伊号的消化系统，远征军放养在其中的动物开始一个一个的被强行吞噬，秦汉唐见状不妙，马上呼叫朱思明将他们传送到了泰瑞纳斯号。
离开之前秦汉唐他们破坏了特洛伊号的超光速引擎，只保留了常规动力引擎，飞行方向依然向着阿瑟维斯星域，然后删除了所有飞船日志，让其孤零零的漂浮在宇宙虚空中，成为了一艘货真价实的幽灵船。
特洛伊号退出多维空间时距离阿瑟维斯星域还有近万光年的距离，此时正处于所有星系之外的虚空地带，附近最近的星域也有上百光年，算得上是前不着村后不着店了。
泰瑞纳斯号已经发现特洛伊号发射出去的定位信号，相信不久之后就会有幽灵族收到信息，远征军现在要做的就是等待鱼儿过来咬钩，为了伪装得像一点，还特地给特洛伊号来了几炮。
秦汉唐他们并没有继续留在泰瑞纳斯号，而是从星门返回了亚特兰蒂斯，宋民妍和伊西斯接下来还有不少试验要做。
泰瑞纳斯号送走tS-1之后就拉开了和特洛伊号的距离，并进入隐身状态，接下来他们需要做的就是耐心潜伏，至于幽灵族的舰队来了之后要怎么做就只能见机行事了。
宋民妍和伊西斯返回亚特兰蒂斯之后要做的就是找到人工合成母巢病毒的办法，虽然她们手上已经有了母巢病毒的原型，但是这些病毒却没办法直接进行武器化。
因为她们之前在提取母巢病毒的时候就发现了一个事情，这些病毒在母舰体内的时候凶悍无比，可一旦被提取出来就开始慢慢失去活性。
为了维持活性这些母巢病毒还会互相吞噬，直到数量降到某个水平才会逐渐消停下来，最后全部归于沉寂，至于在重新被注入动物体内之后病毒会不会重新复苏就需要继续进行活体试验才知道了。
不过宋民妍和伊西斯提取病毒和免疫细胞时都做了两手准备，除了常规提取手段之外，还用低温休眠技术保存了一部分样本。