同样在1499年的夏季，距离喀布尔足足有数千公里之遥的东地中海也同阿富汗斯坦的群山一样沦为了战场。
此时的威尼斯共和国在东地中海还拥有大量的殖民地，她们星罗棋布地分布在各处，依靠海路相连。她们对于威尼斯来说是维系海洋帝国的生命线。
但对于奥斯曼来说，这些威尼斯据点就是“白海美丽面庞上的脓疮”。
巴耶济德已经决意扫除希腊地区的威尼斯统治，他的父皇法提赫苏丹已经拿下了内格罗蓬特，征服莫东、科罗尼、勒班陀等要塞便是巴耶济德接下来要做的。
从年初开始，奥斯曼军队就在为此备战，高门调遣工匠、物资制造军械的动静难以隐瞒。直到四月和五月，奥斯曼依然在想办法麻痹威尼斯人，让他们相信奥斯曼会维持两国之间的和平，接下来的进攻矛头会转向马穆鲁克。
但到六月，科斯坦丁尼耶的威尼斯商人被全部逮捕，月末，凯末尔·雷斯率领的庞大舰队就越过了达达尼尔海峡，同时奥斯曼军队出发穿越希腊的山地，围困了勒班陀要塞，苏丹的目标是什么已经很明显了。
不过威尼斯方面不是全无准备，共和国在3月就任命了一位新的海军司令官——安东尼奥·格里马尼并进行备战工作，两国都在宣扬和平的同时筹备战争。
作为富商的格里马尼在国家财政紧张时自费武装了十艘桨帆船，并向共和国贷款了一万六千杜卡特——以国家食盐贸易收入作为抵押——以从元老院获取了这一职位的任命。
这位格里马尼司令官在获得公职之后展现了强大的钞能力，直到七月，他在莫东集结起了共和国史上最庞大的舰队之一——桨帆船和卡拉克帆船共有95艘，搭载水兵近两万五千人。
因为掌控着这样强大的军势，加上之前传奇一般的商业成功，城内的舆论随即吹嘘起了格里马尼为“又一个亚历山大和凯撒”。
在看完间谍送回的报告后，大致了解了敌军构成和大致动向的他志在必得，威尼斯舰队拥有的卡拉克帆船和重型桨帆船远多于奥斯曼舰队。
凯末尔·雷斯所率领的奥斯曼舰队拥有约260艘战舰，搭载水兵超过三万，但重型军舰仅包括20艘卡拉克帆船和3艘重型桨帆船。
于是在出发前，他给元老院写信道：“诸位元老明鉴，蒙主洪恩，威尼斯的舰队将再一次为共和国带来光荣的胜利。”
到七月末，格里马尼都在跟踪奥斯曼舰队，两支舰队都在沿着希腊地区的海岸线航行。
只是格里马尼一直没抓到什么作战机会，奥斯曼舰队对于与身后的威尼斯舰队决战不感兴趣，他们的首要目标是支援围困勒班陀的陆军。
威尼斯舰队与奥斯曼舰队之间仅爆发多次小规模战斗，奥斯曼人小胜一场，损了格里马尼的颜面。
直到在宗奇奥湾，一股向岸风打向希腊海岸，格里马尼终于得到了与奥斯曼人一决高下的战机。他随即按照传统排兵布阵，所有的重型船舰被安排为前锋用以突破敌军阵线，而机动灵活的轻型船舰则紧随其后，冲入被打乱的敌军舰队进行作战。
他打算施行斩首战术，抽调两艘最大的卡拉克帆船专门对付奥斯曼舰队中最大的两艘卡拉克帆船，其中一艘还挂着巴耶济德苏丹的旗帜，他确信那就是旗舰。
与此同时，他还得到了预料之外的增援，原本应该守备科孚岛的安德烈亚·洛雷丹带着舰队不请自来，严重违反了军纪。
洛雷丹登上旗舰打算参与制定作战计划的讨论，但格里马尼立马威胁道：“您应该现在在科孚岛恪尽职守，不要让我向元老院汇报此事。”
但洛雷丹在海军中人气颇高，即便是受元老院任命的格里马尼恼火于他的擅离职守和抢风头，最终也任命他指挥其中一艘负责突击的卡拉克帆船。
洛雷丹备受鼓舞，他在大战爆发前多次参与清剿mu斯林海盗的战事，凯末尔·雷斯这个海盗头领是他屡次求而不得的目标。
但威尼斯舰队内部并不和睦，在结束会议之后，各个下级指挥官或是认为格里马尼的命令不合理，“充满漏洞”，或是故意扭曲总司令的命令。
此前为了备战，总司令阁下下令征用了共和国的大量桨帆船，这些国营商用桨帆船原本已经通过拍卖承包给了各个商人，原本应该出现在埃及或是黎凡特的商船被强行征用，投标人则被授予舰长的职务。
这也顺理成章地引发了被征召者的不满，即便是威尼斯法律规定不服从的投标人会被罚款并驱逐出威尼斯五年，仍有人拒绝服从格里马尼。
而征召商船也导致了威尼斯对外贸易的停摆，原本应从黎凡特和埃及进口的货物价格飙升。
在所有人的注视下，两艘卡拉克帆船率先脱离大部队向奥斯曼舰队冲去，即便是普通水手和桨手也高呼着：“洛雷丹！胜利！”
一大群奥斯曼桨帆船随即上前拦截，双方的卡拉克帆船都打开了侧舷的炮窗，重炮的骇人轰击让不少附近的水兵都魂飞魄散。同时在甲板和桅杆的了望平台挤满了水兵，他们相互发射着铅弹和箭矢，并尝试进行跳帮作战。
前线战事的惨烈似乎是吓惨了指挥官们，在格里马尼升起十字架向下级指挥官传达进攻命令时，他们几乎无动于衷。
负责指挥所有卡拉克帆船的阿尔维斯·马尔切洛仅仅俘虏了一艘奥斯曼桨帆船之后便撤退了。重型桨帆船的表现也不遑多让，她们之中仅有一艘加入激战，在击退多艘奥斯曼桨帆船的进攻后撤了回来。
被安排在最前方的重型船只几乎不再理会格里马尼的命令，她们既不前进，也不后退。被部署至后方的轻型桨帆船不断催促着挡在她们前面的重型船只前进，但直到战役结束，参加战斗的轻型船只也仅有来自科孚岛的那几艘，她们没有加入列阵。
但即便如此，洛雷丹依然表现神勇，威尼斯的水兵们杀得奥斯曼水兵节节败退，逼得指挥这艘挂着苏丹旗帜巨舰的布拉克·雷斯在转移旗帜之后，用殉爆的方式击毁这两艘威尼斯卡拉克帆船。
巨舰熊熊燃烧的模样吓崩了威尼斯人最后的胆气，他们就是看着奥斯曼轻型桨帆船围绕着这个巨大的火焰金字塔东奔西走，搭救不少己方士兵，击杀威尼斯人。
面对这一状况，格里马尼也无能为力，他不可能按照军法处理超过五分之四的舰长，只好命令舰队撤退到外海，放任胜利者航向勒班陀。前来支援威尼斯的法国舰队在看到如此情形之后，表示拒绝参战，并将格里马尼狠狠羞辱了一番：“您的舰队看上去很壮丽，但没有人会指望您能做任何有用的事。”
在要塞内，孤立无援的威尼斯守军已经打退了奥斯曼人的数次进攻，当他们看到远处海平面上的船帆时，他们欢呼得敲响了教堂的钟，士气振奋。
但随着奥斯曼舰队的靠近，他们惊讶地发现船只上悬挂的旗帜图案是新月，而非圣马可雄狮。凯末尔·雷斯率领舰队进入勒班陀不到一小时，守军就迅速投降了。